OnPLS integration of transcriptomic, proteomic and metabolomic data shows multi-level oxidative stress responses in the cambium of transgenic hipI- superoxide dismutase Populus plants

Sammanfattning

Conclusion: The proposed data evaluation strategy shows an efficient way of compiling complex, multi-platform datasets to obtain significant biological information.

Nyckelord

Statistical integration; OnPLS; Poplar; Oxidative stress; Systems biology

Publicerad i

BMC Genomics
2013, volym: 14, artikelnummer: 893
Utgivare: BIOMED CENTRAL LTD

SLU författare

• Srivastava, Vaibhav

  • Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    
  • AlbaNova Universitetscentrum

• Obudulu, Ogonna

  • Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    
  • Umeå Universitet

• Bygdell, Joakim

  • Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Nilsson, Robert

  • Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    
  • Luleå Tekniska Universitet

• Ahnlund, Maria

  • Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Johansson, Annika

  • Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Moritz, Thomas

  • Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    

• Wingsle, Gunnar

  • Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, Sveriges lantbruksuniversitet
    

UKÄ forskningsämne

Utvecklingsbiologi

Publikationens identifierare

• DOI: https://doi.org/10.1186/1471-2164-14-893

Permanent länk till denna sida (URI)

https://res.slu.se/id/publ/52736